日軍大舉入朝
當東學黨起義軍勝利發展之時，日本報紙爭相傳布，物議紛紛。一些擴張主義者更趁機大造輿論，促使政府出兵。日本各報還用詩歌的形式宣揚“日本刀”和“日本魂”，煽動戰爭歇斯底裏。有的鼓吹“宜揚國威此其時，百年大計在一戰”。注1有的則公然鼓吹滅亡朝鮮，說什麽“五百年而李氏亡，果然劫運應紅羊”。注2外務大臣陸奧宗光也認為此乃確立日本在朝鮮的勢力之難得良機，切不可失之交臂。注3但從外交的角度考慮問題，陸奧感到此時出兵未免過早，而出兵總須有所借口，故頗寄希望於朝鮮政府之請求中國派兵，然後伺機行事。因此，他指示杉村密切注視朝鮮政府與袁世凱之間的聯係，查清事實回報。
事實上，日本軍事當局已在進行出兵的準備。掌握軍事大權的參謀次長川上操六態度尤為積極，他先派駐朝鮮使館武官陸軍炮兵大尉渡邊鐵太郎，赴接近變亂地方之釜山搜集情報。其後，複以參謀總長的名義派陸軍炮兵少佐伊知地幸介至釜山，繼續進行調查。三十日，伊知地調查完畢後返回日本。聽取伊知地匯報之後，軍部內出兵聲浪益盛。川上操六遂以總參謀長的名義向伊藤博文建議：“東學黨匪勢甚為猖獗，韓兵無力鎮壓，目下趨勢必向清國請求援兵，清國政府亦必至允納此種要求。如欲保護在韓臣民，維持帝國權勢，我亦有出兵之必要。”注4同時，秘密著手進行戰爭動員。以參謀本部第一局長陸軍步兵大佐寺內正毅為主任，工兵少佐小根武亮、海軍大尉鬆本和、工兵大尉井上仁郎，騎兵大尉西田治六為組員，專門掌管輸送陸軍事務，以備戰爭爆發後成立運輸通訊部。當天，陸奧宗光和正在國內休假的駐朝鮮公使大鳥圭介進行了會談。三十一日，又就出兵規模及手續等問題進一步征求大鳥的意見。大鳥特別提醒說：從天津到仁川需兩天兩夜，而日本軍隊從門司出發到仁川則需四天四夜，若不早作充分準備，將有中國執先鞭之患。
六月二日，伊藤博文在官邸召開內閣會議。適日本外務省突接衫村濬之急電，報告朝鮮政府已向袁世凱提出中國出兵的請求。陸奧宗光如獲至寶，持此電出席內閣會議，首先將電文交給閣員們傳閱。然後，陸奧提出意見說：“如果中國確有向朝鮮派遣軍隊的事實，不問其用任何名義，我國也必須向朝鮮派遣相當的軍隊，以備不測，並維持中日兩國在朝鮮的均勢。”注5當時，伊藤內閣正陷於危機之中。伊藤博文所處的地位是，要麽實行內閣總辭職，要麽解散議會：二者必居其一。而且，他本人已決意采取後一種手段。杉村的急電和陸奧的意見，不僅使政府排除上述兩種手段有了可能，而且提供了把國內矛盾轉向國外的絕好時機。因此，閣員莫不同意陸奧的意見。於是，伊藤立即派人請參謀總長有棲川熾仁親王和參謀次長川上操六參加會議，並對出兵朝鮮問題作出了秘密決議。伊藤隨即攜帶此項秘密決議進宮，上奏於明治天皇，得到了裁可。
當天夜裏，陸奧宗光和外務次官林董將川上操六請到外相官邸，三人對坐討淪落實出兵朝鮮的計劃。討論中一致認為；日本出兵，必然要與清兵發生對抗。中國所派軍隊當不至於超過五千人，而日本要居於必勝地位，需要六千至七千兵力。如果中國進一步增加兵力，日本也要增派一個師團。因此，應作派出一個師團的準備，而首先派出一個混成旅團。林董後來回憶說：當天的會議“不是議論怎麽和平解決問題，而是討論了怎樣進行作戰和如何取勝的問題”。注6六月三日，袁世凱派譯員蔡紹基通知杉村濬，朝鮮政府已經正式提出請求派遣援兵。杉村立即急電報告政府。同時，日本駐中國臨時公使小村壽太郎也有報告到外務省。四日，陸奧命大鳥圭介即日到外務省，授以訓令，命其迅速回任。大鳥臨行前，陸奧又特別指示：“倘局勢緊急不及請示本國訓令時，該公使得采取認為適當的便宜措施。”盡管陸奧後來自我辯解說：“在這種形勢下，對派往外國的使節給與非常的權力，也是不得已的。”注7這實際上是把挑起戰端的任務完全交給了大鳥。
五日，日本根據戰時條例，正式成立了大本營。其主要機構及成員如下：侍從武官 侍從武官長陸軍少將岡澤精侍從步兵中佐中村覺、海軍少佐齋藤實、海軍大尉川島令次郎軍事內務局 局長陸軍少將岡澤精(兼)局員海軍少佐三須宗太郎，陸軍憲兵大尉係賀虎次郎、海軍大尉丹羽教忠(一八九四年九月一日步兵大佐田村寬一補任，同年十月二十五日免，以步兵大佐真鍋文武接任)幕 僚 長 參謀總長陸軍大將有棲川熾仁親王(一八九五年一月二十四日熾仁死，二十六日以小鬆彰仁親王接任)陸軍參謀 參謀次長陸軍中將川上操六海軍參謀 海軍軍令部長海軍中將子爵中牟田倉之助(一八九四年七月十七日，海軍中將子爵樺山資紀接任)兵站總監部 總監陸軍中將川上操六(兼)參謀陸軍步兵少佐田村怡與造(一八九四年八月二十七日步兵中佐高木作藏接任)運輸通信部 長官陸軍步兵大佐寺內正毅鐵路船舶運輸委員陸軍工兵少佐山根武亮(一八九四年十月一日免)野戰高等電信部長陸軍工兵少佐渡部當次野戰高等郵便部長遞信書記官湯川寬吉野戰監督部 長官野田豁道
野戰衛生部 長官石黑忠惠
管 理 部 部長陸軍炮兵少佐村田惇陸 軍 部 陸軍大臣陸軍大將伯爵大山岩(一八九四年九月二十五日海軍大將西鄉從道兼任)副官陸軍炮兵少佐福家安定
海 軍 部 海軍大臣海軍大將伯爵西鄉從道副官海軍大佐山本權兵衛
按照戰時大本營條例，軍事動員計劃，出兵數量以及運輸計劃等等都完全歸軍事統帥掌管，而由大本營決定，內閣大臣在法製方麵也無權進行幹預。當時，日本僅決定派出一個混成旅團，從指揮上說，並無設立如此龐大的大本營之必要。其所以如此，蓋日本參謀本部早有必戰之心，而伊藤博文在外交上尚頗有顧慮。一時舉棋不定，軍部正可借此收取內閣“對清，韓大方針決定之權，而極力以導引開戰為有利之陰謀”。注8同一天，明治天皇批準向朝鮮派出一個混成旅團，並向駐廣島的第五師團下達了擴充兵員的旨令。
當天下午，大鳥圭介偕同外務省參事官本野一郎，海軍軍令部第二局員海軍少佐安原金次，乘巡洋艦八重山號自橫須賀啟航返回任所。警視廳警部及巡查二十名隨行，以護衛公使。出發之前，海軍大臣西鄉從道指示八重山艦長海軍大佐平山藤次郎，要與公使共進退；抵仁川後，公使如認為必要，除該艦臨時搭乘之七十名官兵外，尚可與停泊仁川港之帝國軍艦各艦長協議，務派多數陸戰隊登陸以待命。
半夜十一時半，杉村濬接到陸奧宗光的電報：“大鳥公使於六月五日午後一時乘八重山艦從橫須賀起錨去仁川，有三百名水手和二十名警察作為警衛隨行。但水兵出發一事，在新的訓令到達之前不得公開。”六日，杉村向朝鮮外務督辦趙秉稷和袁世凱通報大鳥公使已出發回任，同時“透露了作為護衛率來警察二十名，但對水兵同來一事秘而不宣”。注9七日，當大鳥一行已在駛往朝鮮的途中時，日本始將出兵決定正式照會中國。當天，日本駐天津領事荒川已次持外務省電報來見李鴻章，稱；“韓事多警，日本已派兵往保護使署領事及商民。”李鴻章對荒川說：“漢城，仁、釜各口現俱安靜，中國派兵專剿內地土匪，並不至漢及通商務口。汝國似不必派兵，致人驚疑。”又謂，“如已派保護官商，斷不可多，且非韓請派，斷不可入內地，致華日兵相遇生釁。”注10九日，總理衙門以同樣的理由複照駁之。日本挑釁之心已定，當然不會就此罷休，便於十二日照會總理衙門，聲稱：“此次我國派兵朝鮮，是憑《濟物浦條約》而於為之，遵照《天津條約》辦理在案。其應畿多調派，我政府不得不自行定奪。其應如何行動，非所掣肘。”注11其險惡居心已昭然若揭。
九日拂曉，八重山駛至豐島附近海麵，與擔任警備的日艦築紫號相遇，得知中國軍隊業已到達牙山灣。下午三時，八重山進入仁川港。在此之前：日本常備艦隊司令海軍中尉伊東祐亨正率鬆島、千代田、高雄三艦停泊於福建閩江口之馬祖島，西鄉從道令其回航釜山。伊東留速力遲緩的高雄在後，即率鬆島，千代田二艦急駛釜山。日本駐釜山總領事室田義文向伊東傳達了海軍大臣“赴仁川”的命令。伊東即留高雄於釜山，率鬆島和千代田啟航，稍後於八重山而抵仁川。此時，泊仁川港的日本軍艦為鬆島、千代田、八重山，築紫、大和、赤城六艘，而中國僅有濟遠、揚威、平遠三艦。日本海軍力量遠遠淩駕於中國海軍之上。
伊東祐亨抵仁川後，即至八重山艦會見大鳥圭介，商討進兵的計劃。當時決定，大鳥於明日登岸赴漢城任所，伊東則自各艦抽調人員編成聯合陸戰隊登陸護衛。聯合陸戰隊由鬆島副艦長海軍少佐向山慎吉任指揮官兼大隊長，海軍大尉中川藤次郎為大隊副官，海軍大尉島村速雄，井上保為大隊參謀，包括海軍大尉穀雅四郎、仙頭武夫為中隊長的兩個中隊的槍隊，及海軍大尉名利又八郎為中隊長的一個中隊的野炮隊(有野炮四門)注12，共官佐二十八人，士兵四百零五人。當天晚上十時許，陸戰隊全部上岸，駐紮於仁川日租界。十日淩晨三時，全隊集合於日本總領事館。四時，槍隊和炮隊同時出發：槍隊由陸路護送大鳥進入漢城，炮隊取道水路，乘汽船順明號溯漢江而上，在龍山登陸。是日下午，大鳥在麻浦乘渡船過漢江，自南門入城，於午後六時四十五分抵公使館。
先是朝鮮政府接到日本出兵通知後，外務督辦趙秉稷曾於八日派主事李鶴圭至日本公使館，質問其出兵理由。及至聞大鳥圭介將率兵入京，急遣外務衙門參議美人李仙得及外務參議閔商鎬至仁川勸阻，因大鳥已從仁川出發，未能遇上。朝鮮政府又派外務協辦李容植迎至漢江左岸，在麻浦附近會見大鳥，告以京城平穩，勿需率兵入城，井勸其返回。雙方爭論相當激烈，大鳥堅持不允，終於當天十日午後六時半入京。聯合陸戰隊除一小隊駐木覓山之麓外，餘均隨大鳥入城，設大隊本部於市川旅館內。十一日，趙秉稷親訪大鳥，抗議日兵入京，並要求日本急速撤兵。日本國內還在繼續動員增兵朝鮮，大鳥當然不會接受朝鮮政府的撤兵要求，因此斷然予以拒絕。
宇品附近的第九旅團兩個聯隊，加以騎、炮，輜重、衛生等隊，編為混成旅團，以陸軍少將大島義昌為旅團長。大島混成旅團主要包括步兵第十一聯隊、第二十一聯隊，騎兵一個中隊和野戰炮兵一個大隊(野炮十二門)，合計七千六百多人。混成旅團至六月十日編製完畢。本來，大本營打算等混成旅團組織動員後再行出兵。可是，在此前數日，日本大本營接駐華武官陸軍少佐神尾光臣電報，謂中國第一批派遣軍定於六日由山海關出發。日本大本營怕中國先行一步，於是改變計劃，不等混成旅團編製完畢，先派步兵一大隊作為先遣隊出發。野津道貫即令大島義昌先遣第十一聯隊第一大隊長步兵少佐一戶兵衛，率其所部步兵一大隊，並附以工兵一小隊，於八日從宇品上運輸船和歌浦丸。九日，和歌浦丸在高雄艦護衛下出發。十二日，一戶抵仁川，急率部登陸。十三日，一戶率隊進漢城，以接替海軍少佐向山慎吉的聯合陸戰隊，使其返回本艦。
在此以前，陸軍省先與日本郵船株式會社訂立了租船租約，租用山城丸、和歌浦丸，近江丸，酒田丸注13，熊本丸，遠江丸、仙台丸、越後丸、兵庫丸、住江丸十艘輪船，作為運兵之用。後又與大阪商船會社租用木曾川丸、築後川丸兩船，專備釜山，仁川間海路通信之用。於是，大島義昌少將率已準備好的第一批部隊分登近江丸，熊本丸、遠江丸，越後丸，酒田丸五船，於六月十日自宇品出港先發。續發部隊分乘住江丸，兵庫丸，仙台丸，山城丸四船，亦於十一日出港，至十三日追及先發各船。日本運兵船由吉野艦護船，於十五日先後進入仁川港。十六日，全隊登陸。大島將旅團司令部設於仁川的水津旅館。此次共運步兵一聯隊、騎兵一中隊、炮兵一中隊、工兵一中隊、輜重兵半中隊，野戰病院一個、兵站監部及司令部，共二千六百七十三人，馬一百八十六匹。加上一戶兵衛所帶的先遣部隊，混成旅團入朝人數近四千人。
此時，日軍入朝人數除陸軍近四千人外，海軍則有鬆島、吉野、千代田、八重山、築紫、大和、高雄、赤城八艦，兵力遠在中國軍隊以上，已占有絕對的優勢。