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碇唯，碇真嗣的母親，碇源堂的妻子，也是對初號機，使徒等研究的主要成員。
1999年曾寫過一份‘很有趣’的生物工程學報告，得到冬月賞識，這份報告內容不祥，有人新懷疑是a10神經元相關理論的雛形，但雷哲卻翻查過相關資料得知，其實早在1999年之前，碇唯就已經開始研究‘a10神經元’，而她在1999年所寫的生物工程報告，已經是相當成熟的理論。
在結識碇源堂前就已經是seele其轄下組織的成員，但當時她並非直屬seele，而是另一個相關部門，名叫‘gehirn’既‘腦靈’，也就是nerv的前身，後來被改建成nerv，這是在初號機第一次同步率提升到400%，碇唯與之融合後的事情。
1999年秋天前後開始和碇源堂交往，隨後2000年參加葛城調查隊前往南極，但在第二次衝擊前，一同研究被發現的亞當，進行解封研究，但隨後沒多久她就離開南極回到日本，其中有組織安排的其它任務，也有私人問題，在第二次衝擊之前和碇源堂完婚，不久之後第二次衝擊降臨，二分之一的人類死在這場浩劫中，碇唯因為當時在秘密實驗室，所以幸存下來。
第二次衝擊過後，碇唯確認懷孕，但她依然堅持參與人工進化研究所的工作，以及e計劃，而她所負責的依然跟a10神經元有關，但涉及的東西卻變得更廣泛。
2001年，第二次衝擊過後的一年，碇真嗣誕生，可以說這就是一切的開始，不光是他，基本上所有在日後登場的駕駛員，都在同一年出生。
在接下來的三年中，碇唯因為解除的研究越來越多，導致她所知道的事情也越來越多，包括seele高層所要執行的‘人類補完計劃’，而在這個過程中，碇源堂也靠自己的本事，做到研究所所長的位置，並且開始解除更多的秘密。
作為研究的主要參與人員，碇唯並不讚同seele的計劃，碇唯是打算將人寄生於eva上，獲得永久壽命。
與人類補完計劃不同，這裏沒有因為人失去形體而相互融合的打算，為此與初號機的融合是必不可少的，因為在研究的過程中，碇唯發現一些突破性的問題，但他並沒有將其告訴seele，也正是因為如此她參與了之後的試驗，並且在高達400%的同步率中，不管是身體還是靈魂都與初號機融合。
而在這之後，碇源堂所努力的方向也發生變化，‘人類補完計劃’將人類從原罪中解救出來的計劃，即將所有人的靈魂匯集在一起，通過中和每個人的at力場，使每個人回歸lcl之海，而碇源堂的補完不同，他隻是想通過補完自己，讓自己見到碇唯，兩者的衝突導致了最後nerv與seele的矛盾。
死海文書上預言的最終事件，也是seele試圖實現的最高目標。
這一衝擊是由亞當和莉莉斯的結合所觸發，並最終創造一個繼承地球上所有人類的神的存在。
nerv和seele的目標，是確保由人類而不是使徒來觸發第三次衝擊，即‘人類補完計劃’。
為實現這一計劃，人類必須擊敗守護‘生命之樹’的使徒，也正是因為這個原因，才會有以初號機為代表的兵器，來擊潰剩下的使徒。
不過說實話，seele的高層並沒有將死海文書完全解讀明白，應該說死海文書上記載的內容，和真正發生的事情並不一樣，可以說死海文書的內容隻是後來人類經過代代口述，然後經過對神的崇敬，美化出來的版本，如果用真實的事件去記錄當時所發生的一切，肯定會有很多地方和神話傳說不符，比如說神並不愛人類，神並非有節操，神隻不過是個宅男，一個吃飽睡，睡醒了吃的年輕人而已，他甚至沒有想過幫助任何生物以及人類，甚至沒有創造過所謂的世界。
但死海文書有一些地方所記載的沒錯，那就是上麵所記載的預言，按道理來說，因為雷哲的關係，2000年所發生的事情應該看作第三次，更早的一次是發生在世界之初，那會是正兒八經的神話時代，天使，神，魔鬼，以及人類共存的時代。
那個時代的人類所擁有的科技，甚至比現在還要發達數千年乃至上萬年，傳說中的亞特蘭蒂斯就屬於那個時代人類的產物，隻不過在第一次衝擊中，亞特蘭蒂斯，以及所有的天使，魔鬼都消失殆盡，留下的隻有殘缺的古卷，這是比死海文書還要古老的卷軸，應該說死海文書就是翻譯這古卷後的結果。
在古卷中，天使，魔鬼，神，亞特蘭蒂斯的滅亡，被稱為第一次衝擊，但最終並沒有被記載下來，古卷中還記載著接下來所會發生的事情，比如說後來所謂的第一次衝擊的‘大洪水’，也有人說第一次衝擊導致恐龍滅亡，各種說法並不統一。
第二次衝擊就是2000年，亞當解除封印時產生的災難，而第三次衝擊，就是最後的補完計劃，讓人類重歸神的懷抱，或者說讓人類成為這個世界新的神靈。
不過應該怎麽說，劇情的主角的確是碇真嗣，淩波麗，明日香，但在雷哲看來真正貫穿整個故事發展的人，卻是隻出現回憶中的女人，碇唯。
更詳細地說，把碇唯說成是具有知性美的聖母也毫不為過，她生性淡薄於一切，平和於人生。
跟她在一起，能夠讓人心底寧靜，碇源堂之所以愛她如此之深，就是因為碇源堂一生充滿了利用與利用，隻有在碇唯這裏，他才可以獲得心靈的寧靜。
雖然不想去改變整個劇情，但雷哲卻很想見見這個女人，雖然說碇源堂最終的願望就是進入eva見到碇唯，但他最終也沒實現這小小的願望，因為這必須和亞當融合，或者說進行補完才可以做到，不過這種事對雷哲來說並不困難，因為不管是精神世界，靈魂世界，還是物質世界，他都能來去自如，當然隻是稍微麻煩一點而已。
……
眼前的世界，的確是自己當初製造出來的天空城，隻不過其它生物將這裏稱呼為‘伊甸園’，神所居住的地方，說實話當初雷哲並沒說明自己的身份，但也許是因為力量最強大的關係，不知從什麽時候起，智慧生物就稱自己為‘神’。
其實拋開《反叛的魯魯修》那個變成自己掌中神國的世界，這裏才是雷哲第一次掌握的世界，他就是這個世界的管理者，而也從這個時候開始，他才真正算一個‘真神’，隻不過他的情況依然有些特殊，那就是這個世界是從阿禮所冒充的真神中以決鬥的方式贏來的，也就是說這是他的私有財產，如果沒有意外，這個世界也將成為繼《反叛的魯魯修》外，雷哲所擁有的第二個掌中神國。
而他在這個世界也不再是平凡的管理者，他有權力去改變世界的進程，走向，發展，以及所有的一切，他可以把這個世界變成魔幻世界，變成仙俠世界，變成科幻世界，變成任何他想要的世界，原本這種世界養成是很不錯的遊戲，而雷哲最開始也的確想要把這裏改編成自己所希望的樣子，可結果卻讓他很悲催，就連他自己都說，他是有史以來最倒黴的真神，有誰能想到他會被自己世界的生物聯手給封印起來？
這周圍的世界並非初號機的精神世界，而是碇唯所幻化出來的，就跟之前所說的，亞當的靈魂在那個胚胎的分裂體中，其他的三個分身中不存在任何精神與靈魂，當碇唯跟初號機的同步達到400%後，她的肉體就被初號機給吞噬，而靈魂也與對方融合，因為初號機是空白狀態，這讓在融合後，她的靈魂占據主導權，雖然她能影響初號機很小的一部分，但關鍵時候還是能發揮出不少的作用。
“話說，你怎麽知道這場景的？初號機應該沒有亞當的記憶才對，不是嗎？”雷哲站在碇唯的麵前這樣問道，按道理來說初號機並沒有任何記憶，就算碇唯真的與對方融合，也不會窺探到這些才對，所以雷哲表示有些好奇。
懷中抱著一個熟睡的嬰兒，碇唯抬起頭看向雷哲，接著她手中的嬰兒消失，原來那隻不過一個幻象，是碇唯自己幻化出來剛出生時的碇真嗣，看來她真的很愛自己的兒子。
“這一切，我並非從亞當那裏知道，而是從另外一個人，也許他你很熟悉，那個人叫撒旦。”碇唯這樣說道，不過她的話剛說完，站在自己麵前的雷哲氣息瞬間改變，雖然還是帶著笑容，但那淡淡的殺意卻開始向外蔓延，甚至如同觸手一樣懸浮在碇唯的周圍，甚至有點想要把對方纏住，撕碎一樣。
在最近這段時間中，撒旦對雷哲來說是絕對的禁語，當初自己之所以這樣倒黴，就是因為那個混蛋，他發誓要把撒旦給揪出來，然後狠狠給對方兩巴掌，最後掛到城牆上去鞭屍，明明自己有機會將這個世界改造成所需要的那樣，但正因為對方的關係，浪費自己如此多的時間不說，竟然還讓這個世界馬上就要走向滅亡。
“你很痛恨他？因為他之前對你所作所為？如果你見到他，你會怎麽辦，殺掉他嗎？”碇唯這樣問道，她看到許多東西，當然知道雷哲的身份是什麽，雖然研究很長時間的e計劃以及死海文書，但她怎麽也沒想到神是真的存在，第一次和神對話，她覺得挺有意思。
“告訴我，撒旦在什麽地方，我找了他很久，可是卻無法找到對方的蹤跡，或者說換一種說法，撒旦還活這麽？我不覺得在最後的最後，他能在我的攻擊下存活下來，雖然我一直告訴自己他已經死了，但直覺卻說他還活著。”
“他的確還活著，應該說或的還算不錯吧，不過我並不想告訴你一切，全知全能的神啊，你不覺得如果說出來，凡事就會變得沒有意義了嗎？你真的想要找出撒旦來嗎？撒旦的失蹤可能並沒有讓你感到不快，相反樂在其中吧，你在搜索撒旦的下落，而且還是用最普通的方式，你沒有使用自己的力量和權力，因為這會讓整件事都變得普通起來，你想要的不是結果，而是這過程，不是嗎？”
碇唯平靜的說道，而雷哲身上湧現出來的氣息也漸漸消失，最終他嘿嘿笑著，這個女人有點意思，不對，應該說真的太有意思了，平常人如果知道雷哲的身份，肯定會嚇得說不出話來，就算是葛城父女在麵對自己時也會變得相當拘束，但她並沒有，她可以輕鬆的和自己交談，甚至來試著主導話語權，有時候她所說的話的確讓人不爽，但偏偏她的態度卻讓人無法生氣。
“這有什麽好笑的嗎？”
“稍微有點覺得好笑啊，說實話我來見你也隻是一時興起，因為我很想看看你這位在日後的劇本中有決定性作用的人究竟是什麽樣子，結果我發現你挺有趣的，怎麽說呢，我認識不少女人，她們跟你都挺像的，你不怕我嗎？”
“不，因為我從撒旦的記憶中看到，您跟想象中的神並不一樣，而且如果我真的對你畢恭畢敬的，你還會覺得很不自在，不是嗎？”
“不錯不錯，你貌似真看到不少東西，看來今天我並沒有白跑一趟，你果然是有意思的女人，我的目地已經達到了，作為你告訴我撒旦還活著的情報，我可以幫你做一件事情，你好像無法放下自己的兒子碇真嗣，日後我會照顧他的。”